Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MKRN4PQ13434 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MKRN4PQ13434 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
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