Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
PRDM2Q13029 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRDM2Q13029 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRDM2Q13029 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms