Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HSPB3Q12988 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HSPB3Q12988 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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