Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TROQ12816 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TROQ12816 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TROQ12816 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TROQ12816 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TROQ12816 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TROQ12816 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TROQ12816 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TROQ12816 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TROQ12816 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TROQ12816 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TROQ12816 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TROQ12816 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TROQ12816 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TROQ12816 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TROQ12816 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TROQ12816 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TROQ12816 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TROQ12816 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TROQ12816 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
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