Protein–RNA interactions for Protein: Q12460

NOP56, Nucleolar protein 56, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP56Q12460 YOR121CYOR121C 306 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 EGD1YPL037C 474 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YKU80YMR106C 1890 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 COX1Q0045 1605 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 SIR3YLR442C 2937 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 FIR1YER032W 2631 nt2.85□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 ORC1YML065W 2745 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 FLO5YHR211W 3228 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 KSP1YHR082C 3090 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YDL041WYDL041W 354 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 URM1YIL008W 300 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YLR031WYLR031W 561 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 FPR1YNL135C 345 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 ATP3YBR039W 936 nt2.84□□□□□ -1.95
NOP56Q12460 ISW1YBR245C 3390 nt2.84□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 GCD6YDR211W 2139 nt2.83□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YGR035CYGR035C 351 nt2.83□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YPR089WYPR089W 2667 nt2.83□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 AYR1YIL124W 894 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 RNP1YLL046C 750 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 MSL5YLR116W 1431 nt2.82□□□□□ -1.96 RIP-Chip
NOP56Q12460 SHQ1YIL104C 1524 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 PHO2YDL106C 1680 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 TOP2YNL088W 4287 nt2.82□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YBL071CYBL071C 309 nt2.81□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 AYT1YLL063C 1425 nt2.81□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 IRC10YOL015W 1761 nt2.81□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 SAK1YER129W 3429 nt2.81□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 SSN2YDR443C 4263 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 MZM1YDR493W 372 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YNL010WYNL010W 726 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YPL238CYPL238C 390 nt2.8□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 ORC2YBR060C 1863 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 TLC1TLC1 1301 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 snR79snR79 84 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 RTT102YGR275W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 PRE8YML092C 753 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 COQ10YOL008W 624 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 CRS5YOR031W 210 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 ROX1YPR065W 1107 nt2.79□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 PRP6YBR055C 2700 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YDR193WYDR193W 399 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 RPS18BYML026C 441 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 KTI11YBL071W-A 249 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 SIN3YOL004W 4611 nt2.78□□□□□ -1.96
NOP56Q12460 SDC25YLL016W 3147 nt2.77□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 TMA22YJR014W 597 nt2.77□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 RPL36AYMR194W 303 nt2.77□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YEF3YLR249W 3135 nt2.77□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 PTC5YOR090C 1719 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YBT1YLL048C 4986 nt2.76□□□□□ -1.97 RIP-Chip
NOP56Q12460 RPL40BYKR094C 387 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YHR078WYHR078W 1659 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 UBP11YKR098C 2154 nt2.76□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YJL070CYJL070C 2667 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 FMP32YFL046W 624 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 KEL2YGR238C 2649 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 RRP12YPL012W 3687 nt2.75□□□□□ -1.97 RIP-Chip
NOP56Q12460 NCL1YBL024W 2055 nt2.75□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YJR003CYJR003C 1560 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 SNT1YCR033W 3681 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YJL202CYJL202C 348 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 VTI1YMR197C 654 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YMR324CYMR324C 243 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YNL146WYNL146W 303 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 SNU114YKL173W 3027 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 CDC24YAL041W 2565 nt2.74□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 GIN4YDR507C 3429 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YJR098CYJR098C 1971 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 LSM7YNL147W 348 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 REV1YOR346W 2958 nt2.73□□□□□ -1.97 RIP-Chip
NOP56Q12460 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YSY6YBR162W-A 198 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 snR42snR42 351 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 IPT1YDR072C 1584 nt2.73□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 MPH1YIR002C 2982 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YER121WYER121W 345 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YFR056CYFR056C 369 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 PAU14YIL176C 363 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 PAU1YJL223C 363 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 FCF2YLR051C 654 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 CGI121YML036W 546 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YBL108WYBL108W 306 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YPR146CYPR146C 330 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
NOP56Q12460 YER138CYER138C 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
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