Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
IFFO1Q0D2I5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IFFO1Q0D2I5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms