Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC8Q09428 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ABCC8Q09428 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms