Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDE4DQ08499 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms