Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LGALS3BPQ08380 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGALS3BPQ08380 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms