Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTDSPL2Q05D32 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTDSPL2Q05D32 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms