Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms