Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NHLH2Q02577 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NHLH2Q02577 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms