Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DEFA6Q01524 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEFA6Q01524 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms