Protein–RNA interactions for Protein: Q01415

GALK2, N-acetylgalactosamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALK2Q01415 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GALK2Q01415 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms