Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDK5Q00535 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDK5Q00535 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms