Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CDK6Q00534 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms