Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CDK3Q00526 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms