Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXO4P98177 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXO4P98177 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms