Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VLDLRP98155 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VLDLRP98155 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms