Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HTD2P86397 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTD2P86397 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTD2P86397 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HTD2P86397 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HTD2P86397 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HTD2P86397 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms