Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUCB2P80303 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms