Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCL7P80098 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL7P80098 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL7P80098 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL7P80098 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL7P80098 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCL7P80098 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCL7P80098 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCL7P80098 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCL7P80098 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms