Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GTF2IP78347 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GTF2IP78347 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms