Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL11P62913 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPL11P62913 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms