Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNRPD3P62318 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms