Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP6V0D1P61421 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP6V0D1P61421 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms