Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB5BP61020 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB5BP61020 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms