Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVFC1P60507 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVFC1P60507 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms