Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CABP4P57796 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CABP4P57796 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CABP4P57796 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CABP4P57796 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CABP4P57796 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CABP4P57796 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CABP4P57796 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms