Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PGGT1BP53609 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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