Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRCA2P51587 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRCA2P51587 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms