Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TAF6P49848 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TAF6P49848 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TAF6P49848 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TAF6P49848 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TAF6P49848 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TAF6P49848 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms