Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXA1P49639 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA1P49639 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms