Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDC34P49427 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDC34P49427 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC34P49427 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC34P49427 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC34P49427 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms