Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUFMP49411 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUFMP49411 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUFMP49411 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUFMP49411 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUFMP49411 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUFMP49411 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUFMP49411 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUFMP49411 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUFMP49411 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFMP49411 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFMP49411 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFMP49411 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUFMP49411 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms