Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AMTP48728 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMTP48728 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMTP48728 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMTP48728 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMTP48728 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms