Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCLCP48506 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCLCP48506 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCLCP48506 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCLCP48506 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCLCP48506 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCLCP48506 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms