Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF4P48230 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms