Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDKN1BP46527 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDKN1BP46527 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms