Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP5P45974 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP5P45974 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP5P45974 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP5P45974 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP5P45974 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP5P45974 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP5P45974 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP5P45974 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP5P45974 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP5P45974 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP5P45974 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP5P45974 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms