Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MLH1P40692 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH1P40692 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH1P40692 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH1P40692 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH1P40692 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH1P40692 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MLH1P40692 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MLH1P40692 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MLH1P40692 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms