Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNA7P36544 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNA7P36544 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms