Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP5C1P36542 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms