Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SFTPDP35247 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFTPDP35247 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms