Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL9P32969 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL9P32969 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL9P32969 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL9P32969 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL9P32969 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL9P32969 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL9P32969 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL9P32969 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL9P32969 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL9P32969 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL9P32969 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL9P32969 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL9P32969 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL9P32969 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL9P32969 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL9P32969 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms