Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD1P29536 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMOD1P29536 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms