Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2E2P29084 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms