Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPRMP28827 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRMP28827 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
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