Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-DMAP28067 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HLA-DMAP28067 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms