Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYF6P23409 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYF6P23409 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYF6P23409 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MYF6P23409 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MYF6P23409 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms